根据南京师范大学做优做强教师教育的要求，教师教育学院在教育学一级学科下设置了教师教育专业硕士学位点，面向基础教育开展了研究生层次的教师教育。学院通过免试推荐的方式，遴选了5届各学科优秀本科生进入教师教育专业进行“4+2”模式本硕贯通培养，同时面向全国统招各学科研究生，覆盖中文教育、数学教育、英语教育、物理教育、化学教育、生物教育、思想政治教育、历史教育、地理教育、音乐教育、体育教育、美术教育、现代教育技术、职业技术教育、科学教育、教师教育研究等研究方向。